В фонде антропологии имеются серии костных останков людей с территории Казахстана эпохи бронзы, раннего железного века и тюркского периода. Антропологическая коллекция насчитывает 890 единиц хранения и новые палеоантропологические материалы с территории Казахстана. Основные костные материалы сакского периода происходят с территории Южного Казахстана с городища Чирик-Рабат Кызылординской области, хронологически охватывают ІV – II вв.д.н.э. и могильника Культобе Арысской культуры государства Кангюй, датируемые І – ІVвв.н.э, . В настоящее время данные материалы изучаются по всем параметрам краниологии.
Кроме этого в фонде хранятся одонтологические и дерматоглифические коллекции с территорий Казахстана и Монголии (Баян-Улгий): отпечатки рук — 650 единиц и оттиски зубов — 500 единиц.
Городище Чирик-Рабад, Кызылординская обл. IV-II вв. до н.э.
ЮКО, Арысская культура, могильник Культобе. І –ІV вв. н.э